เอ็มเทคกำหนดกลุ่มเป้าหมายการใช้ประโยชน์จากผลผลิตงานวิจัย เป็น 5 กลุ่มหลัก ได้แก่
1. อุตสาหกรรมการผลิตและบริการทางวิศวกรรม
2. ความปลอดภัยและคุณภาพชีวิต
3. สุขภาพและความเป็นอยู่ที่ดี
4. อุตสาหกรรมฐานเกษตรกรรม
5. เกษตรกรรม
นอกจากนี้ยังมีกลุ่มเทคโนโลยเป้าหมายอีก 1 กลุ่ม คือ พลังงาน